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Die MS Anne (in früheren Erwähnungen M.S. Anne) ist ein großer Luxusliner aus der Kanto-Region. Einmal im Jahr legt sie in Orania City an. Dann wird dort ein großes Fest gefeiert. Um sie zu betreten, benötigt man ein Bootsticket.
Der Kapitän der MS Anne ist anfällig für die Seekrankheit. Der Spieler bekommt, für eine Massage, von ihm die VM01 (Zerschneider). Nachdem das Schiff abgelegt hat, wird man es im Spiel nicht mehr wiedersehen. In Pokémon Feuerrote Edition und Blattgrüne Edition wird der Hafen von Orania City später für die Seesprint-Fähre gebraucht.
In Pokémon: Let’s Go, Pikachu! und Let’s Go, Evoli! trifft man bereits kurz nach dem Betreten des Schiffs auf den Rivalen, aber auch erneut auf Blau Eich, der ein Yantara-Sablé verschenkt. Er berichtet von Team Rocket und sagt, er will sie sich näher ansehen, bevor er das Schiff wieder verlässt. Wenn man die Kabine des Kapitäns betreten will, erscheint der Rivale erneut und es kommt zum Kampf. Nach dem Kampf kann Pikachu bzw. Evoli in seiner Kabine vom Kapitän, dem man zuvor wegen seiner Übelkeit hilft, die Geheime Technik „Spaltschnitt“ erlernen. Verlässt der Protagonist nun die MS Anne, sticht sie in See und ist nicht mehr besuchbar.
Pokémon Rote Edition und Blaue Edition und Pokémon Special Pikachu Edition
In der Episode An Bord der M.S. Anne erhalten Ash, Misty und Rocko ein Ticket für das Schiff, auf dem eine Party für Pokémon-Trainer stattfindet. Später stellt sich heraus, dass Team Rocket geplant hat, alle Pokémon der Passagiere zu stehlen. Nachdem Team Rocket besiegt wurde, gerät das Schiff in einen starken Sturm und versinkt. Alle Personen konnten auf Rettungsbooten gerettet werden, ausgenommen Ash, Misty, Rocko, Jessie und James, die mit dem Schiff untergehen. In der nächsten Episode Das Schiffswrack versuchen die Fünf aus dem Wrack zu entkommen. Ash und seine Freunde schaffen dies mit ihren Wasser-Pokémon, doch Team Rocket geht unter, da James' Karpador nicht schwimmen kann. Kurz nach der Flucht sinkt das Schiff weiter und stürzt unbemannt in einen Abgrund.
In der Chronicles-Episode Die Jagd nach der Legende reist Richie mit der Fähre. Ob das Schiff neu erbaut wurde oder es ein ganz anderes Schiff ist, ist unbekannt. Im japanischen Original ist das Schiff unbenannt.
Die MS Anne ist im Pocket Monsters SPECIAL-Manga das Schiff von Major Bob, das einmal im Monat in Orania City anlegt und ansonsten über die Meere von Kanto und Johto fährt. Rot stiehlt sich in VS. Voltobal als blinder Passagier auf das Schiff, weil er vom Pokémon-Fanclubleiter den Auftrag bekommen hatte, dort gestohlene Pokémon zu suchen. Aber er trifft nur auf einige Elektro-Pokémon von Major Bob, die ihn angreifen. Schließlich muss er sich in VS. Elektek auch gegen Major Bob selbst bewähren, wobei sich sein Quaputzi sogar zu Quappo entwickelt. Dadurch kann Rot ihn besiegen und die gestohlenen Pokémon schlussendlich doch befreien.
Gelb reist während VS. Flegmon mit der MS Anne, als diese durch das Zutun von Roy, Ken und Harry untergeht. Die drei möchten, dass niemand Team Rocket vergisst und bekämpfen Gelb, die sich ihnen entgegen stellt. Es gelingt Gelb schließlich während VS. Rettan, die drei zu besiegen und am Hafen von Orania City festzusetzen.
Später erscheint Major Bob mit der M.S. Anne in der Nähe der Strudelinseln, wo er Gold und Silber trifft.
Der Lastwagen auf dem Dock des Kreuzfahrtschiffes 1. GenerationDer Lastwagen auf dem Dock des Kreuzfahrtschiffes 3. Generation
Auf dem Dock der MS Anne befindet sich ein Lastwagen, den man nur erreichen kann, wenn man VM03 (Surfer) besitzt und das Schiff noch nicht abgelegt hat. Dies ist aber im regulären Spielverlauf der ersten Generation nicht möglich. Dadurch entstanden um dieses auffällige Fahrzeug einige Gerüchte und Spekulationen. Allerdings ist es einfach nur Dekoration, bei dem sich erst in den Remakes, wahrscheinlich als Anspielung darauf, ein verstecktes Item in der Nähe befindet.